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群落組成分析
【添加時(shí)間：2016-09-12 09:28:24】【來源：】【作者：dggadmin】
群落組成分析是基于OTU豐度表及其微生物分類(門、綱、目、科、屬)所做的分析，主要包含以下幾個(gè)方面：
圖1 樣本群落組成圖
圖3.2中各個(gè)數(shù)字代表了某組樣品獨(dú)有或幾組樣品共有的OTU 數(shù)量，對(duì)分析要求：樣品分組至少2個(gè)，最多5 個(gè)。
圖2 樣品OTU 分布Venn圖
1. 樣本群落組成圖
根據(jù)分類學(xué)分析結(jié)果，可以得知多個(gè)樣品在各分類水平上的物種組成比例情況，反映樣品在不同分類學(xué)水平上的群落結(jié)構(gòu)。根據(jù)具體情況可選擇合適的作圖類型（柱狀圖、散點(diǎn)/折線圖、餅圖等）：圖1 樣本群落組成圖
2. 樣品OTU 分布Venn 圖
用于統(tǒng)計(jì)多個(gè)樣品中共有或獨(dú)有的OTU數(shù)目，可以比較直觀地表現(xiàn)各組樣品之間的OTU 組成相似程度。圖3.2中各個(gè)數(shù)字代表了某組樣品獨(dú)有或幾組樣品共有的OTU 數(shù)量，對(duì)分析要求：樣品分組至少2個(gè)，最多5 個(gè)。
圖2 樣品OTU 分布Venn圖
3. 熱圖 (Heatmap)
熱圖用顏色變化來反映微生物群落(或功能)的豐度信息，它可以直觀地將數(shù)值大小用顏色深淺表示出來。也可以將高豐度和低豐度的物種分塊聚集，通過顏色梯度及相似程度來反映多個(gè)樣品在各分類水平上群落組成的相似性和差異性。圖3 高豐度OTU的熱圖
左邊是微生物分類，右邊是OTU編號(hào)，下邊文字是樣品名稱，顏色反映OTU在樣品中的相對(duì)豐度。